염기서열에 모르는 알파벳이 존재할 때 해석하는 방법

우리가 알고 있는 DNA 염기서열울 구성하는 염기는 A (아데닌), T (티민), G (구아닌), C (시토신) 뿐인데,

 

시퀀스에서 낯선 알파벳을 마주할 수 있다.

 

Hetero 등의 이유로 염기서열이 다양할 경우 다른 문자를 사용하여 표기하기 때문이다.

 

프라이머를 디자인할 때 포함하지 않는 것을 권장한다.

 

문자	의미
R	A 또는 G
Y	C 또는 T
S	G 또는 C
W	A 또는 T
K	G 또는 T
M	A 또는 C
B	C 또는 G 또는 T
D	A 또는 G 또는 T
H	A 또는 C 또는 T
V	A 또는 C 또는 G
N	모든 염기